Su sucesor fue Klaus Urbanczyk. Unos días antes del inicio de la segunda mitad de la temporada, el entrenador Pavel Dotchev dimitió sorprendentemente y se trasladó a su antiguo club, el SC Paderborn 07. El FC Rot-Weiß fichó a Karsten Baumann como su sucesor. A principios de los años 1970, la relación de poder en la liga de la RDA cambió. Apenas unos años después de que comenzaran las obras, la nueva casa del Real Madrid, que hoy lleva su nombre, ya tenía una capacidad para 120.000 espectadores, lo que lo convertía en el estadio de fútbol más grande de la época. Hoy, una placa conmemorativa en el Centro de Congresos y Cultura AMO conmemora la fundación de la asociación. Los jugadores, directivos y aficionados del club participaron de forma gratuita en las obras de renovación. Además, desde el 17 de agosto de 2014, se le ha dedicado un monumento financiado por fans. El club atravesaba dificultades financieras desde finales de los años 1990. Con un equipo completamente nuevo, tras la exitosa conclusión del procedimiento de insolvencia se anunció como objetivo para los próximos años regresar a la 3ª liga.

Los años más exitosos del fútbol de Magdeburgo comenzaron en la temporada 1971/72, cuando el equipo más joven de la época, dirigido por el capitán Manfred Zapf, consiguió por primera vez el título de campeón de la RDA, con lo que la FCM se clasificó para la Copa de Europa.. Además, hasta la fecha, el FCM, junto con los Lisbon Lions del Celtic Glasgow, es el único club en la historia del fútbol europeo que ha ganado la copa con un equipo íntegramente local. En la siguiente temporada 1968/69, el equipo tuvo hasta la última jornada la posibilidad de conquistar su primer título de campeonato. El ascenso se determinó matemáticamente tras la 31ª jornada. Después de ganar el segundo título de campeonato el día 8. En mayo de 1974 todavía estaba programada la final de la Recopa de Europa. En la temporada 1969/70, el equipo eliminó al MTK Budapest en la primera ronda de la Recopa de Europa. Sin embargo, dos derrotas por 0-1 significaron el fin del Magdeburgo. Después de dos derrotas en las dos últimas jornadas, el club consiguió el tercer puesto en la clasificación final. Si dos equipos marcaban el mismo número de goles en los dos partidos, se aplicaba la regla de los goles fuera de casa. Para ellos juegan ex jugadores del FC Schalke 04. Olaf Thon es el jefe del departamento desde 2015, Martin Max es su suplente y Thomas Kruse es el director deportivo.

Con jugadores como Jaroslav Kunz y Liang Geliang, el VfB Lübeck logró llegar a lo más alto de la segunda división. En la segunda ronda, el equipo de Krügel fracasó ante la Academica Coimbra de Portugal. Después de los goles del VfL se reproduce un extracto de la canción Rama Lama Ding Dong de Rocky Sharpe And The Replays. Antes de las 20. 000 espectadores en el estadio Rudolf Harbig de Dresde el 1 de junio de 1969, después de dos goles de Jörg Ohm y más goles de Joachim Walter y Jürgen Sparwasser, el equipo venció 4-0 al FC Karl-Marx-Stadt tras una actuación convincente y celebró el tercero. victoria de copa en la historia del club. El máximo goleador de la historia del club con diferencia es Joachim Streich con 223 goles en competición oficial, seguido de Jürgen Sparwasser con 173, Christian Beck con 149 y Günter Hirschmann con 124 goles. La temporada 1973/74 todavía se considera la más exitosa de la historia del club. La plaza frente al MDCC Arena ahora se llama Heinz-Krügel-Platz. El recién llegado alcanzó el tercer puesto en la temporada 1967/68.

Para el Magdeburgo la primera temporada de 1965/66 acabó con el descenso a la liga de la RDA. Aunque los suecos sólo anotaron dos veces desde el punto, lograron pasar a la siguiente ronda gracias a los cinco tiradores de Magdeburgo, solo Wolfgang Steinbach anotó. En la primera ronda de la temporada 1975/76 se batió en duelo con el campeón sueco Malmö FF. A la derrota por 2-1 en Malmö le siguió una victoria en casa por 2-1, por lo que la tanda de penaltis tuvo que determinar el ganador. La decisión sobre el ascenso sólo se tomó en un duelo directo en la última jornada. En la penúltima jornada el equipo consiguió otro campeonato por delante de Carl Zeiss Jena y Dynamo Dresden. El equipo, que con una edad media de 22,3 años fue el equipo campeón más joven en la historia de la Oberliga de la RDA, tuvo que disputar sus duelos fuera de casa y ganó ambos partidos por 2-1 (Jena) y 1-0 (Dresde). Para la temporada 2019/20, el veterano entrenador del segundo equipo, Ante Čović, se hizo cargo del equipo profesional. Después del 1erEl FC Magdeburg ocupó el segundo lugar durante las vacaciones de invierno con tres derrotas, pero en la segunda mitad de la temporada se mantuvo invicto.

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